測功機工作一段時間以后，要進行除垢和清洗。針對用戶所在地區的水質情況，使用不同的清洗液，沿海地區主要是鈉鎂離子形成水垢，內陸地區主要是鈣離子形成水垢。

清洗方法是把渦流制動器上端的排水管拆下，接上清洗軟管，用洗滌泵掇把清洗液不斷地泵入渦流制動器的循環水道，直到水垢被清洗干凈為止。由于清洗液具有一定的腐蝕性，經清洗液清洗后，還要用清水將殘液洗干凈，并用中和液中和處理。清洗間隔時間為一年，發現結垢嚴重時，也可隨時清洗。判斷水垢是否形成，主要有兩個標志：

（1）冷卻水出水流速下降，流量減少；

（2）冷卻水出水溫度上升，手感比正常狀態時溫度高（稍高就已形成一定水垢）。通常這兩種狀態是并存的。